Лаборатория моделирования патологий человека

Кожевникова Елена Николаевна
Заведующий лабораторией

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Кожевникова Елена Николаевна зав. лаб. кбн kozhevnikovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Стручалин Максим Владимирович снс кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Попова Юлия Владимировна нс кбн popovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Зыбкина Анастасия Владимировна нс кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg     Медведева (Сайдакова) Снежанна Сергеевна мнс   medvedevaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Зедан Язан мнс    
        Андреева Елизавета Андреевна ст. лаб.   andreeva [dot] eatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Никельварт Екатерина Александровна ст. лаб.   nikelvartatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg     Ачасова Ксения Михайловна снс совм. кбн achasovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
  scopus_logo.jpg     Морозова Марьяна Владимировна мнс совм. кбн morozovaatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Саейди Арсалан мнс совм.   saeidiatmcb [dot] nsc [dot] ru
        Вихорев Александр Викторович мнс совм.    

Бывшие сотрудники:

Чанушкина Ксения Евгеньевна

Направления исследований: 

Лаборатория моделирования патологий человека исследует молекулярно-генетические механизмы развития воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК) и ассоциированных с ними расстройств. Мы используем лабораторных животных и 3D-органоиды толстой кишки для моделирования ВЗК, комбинируем эти модели с методами конфокальной микроскопии, "-омными" подходами и функциональными тестами для изучения молекулярных механизмов нарушения эпителиального барьера при ВЗК. Также мы исследуем роль микробиоты кишечника и ее метаболизма в регуляции ассоциированных с ВЗК психических расстройств, таких как депрессия и тревожность. 

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Путь к новым методам терапии воспалительных заболеваний кишечника

Микробиота кишечника определяет социальное поведение

Публикации: 

  1. Medvedeva S, Achasova K, Boldyreva L, Ogienko A, Kozhevnikova E. The application of explants, crypts, and organoids as models in intestinal barrier research. Tissue Barriers, 2024, doi: 10.1080/21688370.2024.2423137

  2. Klimenko ES, Sukhareva KS, Vlasova YuA, Smolina NA, Fomicheva YuV, Knyazeva A, Muravyev AS, Sorokina MYu, Gavrilova LS, Boldyreva LV, Medvedeva SS, Sejersen T, Kostareva AA. Flnc expression impacts mitochondrial function, autophagy, and calcium handling in C2C12 cells. (doi: 10.1016/j.yexcr.2024.114174) Exp Cell Res 442(1): 114174, 2024

  3. Boldyreva LV, Morozova MV, Pavlov KS, Kozhevnikova EN. Effect of dietary phospholipid on the behavior in C57BL/6J mice. (doi: 10.1134/S0022093024010319) J Evol Biochem Phys 60: 409-419, 2024 *

  4. Morozova MV, Boldyreva LV, Borisova MA, Kozhevnikova EN. Investigating social communication in mice: A two-intruders test approach. (doi: 10.1002/jnr.25365) J Neurosci Res 102(7): e25365, 2024 *

  5. Morozova M, Andrejeva J, Snytnikova O, Boldyreva L, Tsentalovich Yu, Kozhevnikova E.  Phospholipid supplementation inhibits male and female odor discrimination in mice. (doi: 10.3389/fnbeh.2024.1397284) Front Behav Neurosci 18: 1397284, 2024

  6. Saydakova S, Morozova K, Snytnikova O, Morozova M, Boldyreva L, Kiseleva E, Tsentalovich Y, Kozhevnikova E. The effect of dietary phospholipids on the ultrastructure and function of intestinal epithelial cells. (doi: 10.3390/ijms24021788) Int J Mol Sci 24(2): 1788, 2023

  7. Razuvaeva AV, Graziadio L, Palumbo V, Pavlova GA, Popova JV, Pindyurin AV, Bonaccorsi S, Somma MP, Gatti M. The multiple mitotic roles of the ASPM orthologous proteins: Insight into the etiology of ASPM-dependent microcephaly. (doi: 10.3390/cells12060922) Cells 12(6): 922, 2023

  8. Popova J, Bets V, Kozhevnikova E. Perspectives in genome-editing techniques for livestock. (doi: 10.3390/ani13162580) Animals 13(16): 2580, 2023 *

  9. Morozova MV, Borisova MA, Snytnikova OA, Achasova KM, Litvinova EA, Tsentalovich YuP, Kozhevnikova EN. Colitis-associated intestinal microbiota regulates brain glycine and host behavior in mice. (doi: 10.1038/s41598-022-19219-z) Sci Rep 12: 16345, 2022

  10. Popova JV, Pavlova GA, Razuvaeva AV, Yarinich LA, Andreyeva EN, Anders AF, Galimova YA, Renda F, Somma MP, Pindyurin AV, Gatti M. Genetic control of kinetochore-driven microtubule growth in Drosophila mitosis. (doi: 10.3390/cells11142127) Cells 11(14): 2127, 2022

  11. Бец ВД, Ачасова КМ, Борисова МА, Кожевникова ЕН, Литвинова ЕА. Роль гликопротеина муцин и L-фукозы во взаимодействии иммунитета и микрофлоры на примере экспериментальной модели воспалительных заболеваний кишечника. (doi: 10.31857/S0320972522030046) Биохимия 87(3): 356-375, 2022

  12. Omelina ES, Yushkova AA, Motorina DM, Volegov GA, Kozhevnikova EN, Pindyurin AV. Optogenetic and chemical induction systems for regulation of transgene expression in plants: use in basic and applied research. (doi: 10.3390/ijms23031737) Int J Mol Sci 23(3): 1737, 2022

  13. Morozova MV, Kalmykova GV, Akulova NI, Ites YV, Korkina VI, Litvinova EA. Autoclaved diet with inactivated spores of Bacillus spp. decreased reproductive performance of Muc2−/− and Muc2+/− mice. (doi: 10.3390/ani12182399) Animals 12(18): 2399, 2022 *

  14. Boldyreva LV, Morozova MV, Saydakova SS, Kozhevnikova EN. Fat of the gut: epithelial phospholipids in inflammatory bowel diseases. (doi: 10.3390/ijms222111682) Int J Mol Sci 22(21): 11682, 2021 *

  15. Achasova KM, Kozhevnikova EN, Borisova MA, Litvinova EA. Fucose ameliorates Tritrichomonas sp.-associated illness in tntibiotic-treated Muc2−/− mice. (doi: 10.3390/ijms221910699) Int J Mol Sci 22(19): 10699, 2021

  16. Litvinova EA, Bets VD, Feofanova NA, Gvozdeva OV, Achasova KM, Alperina EL, Kozhevnikova EN. Dietary fucose affects macrophage polarization and reproductive performance in mice. (doi: 10.3390/nu13030855) Nutrients 13(3): 855, 2021

  17. Boldyreva LV, Yarinich LA, Kozhevnikova EN, Ivankin AV, Lebedev MO, Pindyurin AV. Fine gene expression regulation by minor sequence variations downstream of the polyadenylation signal. (doi: 10.1007/s11033-021-06160-z) Mol Biol Rep 48: 1539-1547, 2021

  18. Морозова МВ, Калмыкова ГВ, Акулова НИ, Литвинова ЕА. Определение содержания бактерий рода Bacillus в корме и фекалиях лабораторных мышей при содержании в стерильных и нестерильных условиях. (doi: 10.29296/2618723X-2021-03-02) Лабораторные животные для научных исследований 3: 11-16, 2021 *

  19. Gvozdeva OV, Achasova KM, Litvinova NA, Kozhevnikova EN, Litvinova EA. Female scent activated expression of Arginase1 and inducible NO-Synthetase in lung of BALB/c male mice. (doi: 10.3390/ani11061756) Animals 11(6): 1756, 2021 *

  20. Ачасова КМ, Гвоздева ОВ, Кожевникова ЕН, Литвинова ЕА. Регуляторные Т-клетки лимфатических узлов у Muc2-/- мышей с Helicobacter spp. (doi: 10.15789/1563-0625-LNR-2268) Медицинская иммунология 23(4): 629-634, 2021 *

  21. Borisova MA, Achasova KM, Morozova KN, Andreyeva EN, Litvinova EA, Ogienko AA, Morozova MV, Berkaeva MB, Kiseleva E, Kozhevnikova EN. Mucin-2 knockout is a model of intercellular junction defects, mitochondrial damage and ATP depletion in the intestinal epithelium. (doi: 10.1038/s41598-020-78141-4) Sci Rep 10: 21135, 2020​

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2024-0002 Системы направленной терапии заболеваний человека. Кожевникова ЕН

Гранты РНФ

20-74-10022 (продление на 2023-2024) Механизмы регуляции динамики цитоскелета при развитии воспаления
и формировании защитного барьера кишки на мышиных моделях хронического колита. Кожевникова ЕН

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  • Болдырева ЛВ, Морозова МВ, Медведева СС, Павлов КС, Кожевникова ЕН, Морозова КН, Киселева ЕВ. Влияние приема соевого лецитина на поведение и молекулярно-клеточные процессы в нейронах мозга у лабораторных мышей С57BL/6. Сборник тезисов докладов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием "Учение академика И.П. Павлова в современной системе нейронаук", Санкт-Петербург: ИЭМ, 2024, 588 с, ISBN 978-5-6051655-7-6, с 232-233

  • Медведева СС, Ачасова КМ, Болдырева ЛВ, Огиенко АА, Кожевникова ЕН. Роль церамидов в развитии синдрома повышенной проницаемости кишечника. Сборник тезисов 27-й Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием “Биология - наука XXI века”. Пущино, 2024, c. 298

  • Boldyreva LV, Morozova MV, Medvedeva SS, Kozhevnikova EN, Morozova KN, Kiseleva EV. Dietary lecithin effects on the behavior, brain metabolism, mitochondrial and cellular structure of the neurons in mice. (doi: 10.18699/bgrs2024-10-17) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 1910-1911

  • Morozova M, Andrejeva J, Snytnikova O, Boldyreva L, Tsentalovich Yu, Kozhevnikova E. Phospholipid supplementation inhibits social odor discrimination in mice. (doi: 10.18699/bgrs2024-7.3-11) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 1317

  • Medvedeva SS, Boldyreva LV, Achasova KM, Ogienko AA, Kozhevnikova EN. Disfunction of intercellular junctions in chronic colitis models. (doi: 10.18699/bgrs2024-7.2-08) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 1278-1279

  • Medvedeva S, Boldyreva L, Achasova K, Ogienko A, Kozhevnikova E. Ceramide affects intestinal epithelial barrier integrity via destabilization of actin cytoskeleton in chronic colitis. (doi: 10.18699/bgrs2024-7.2-07) Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология. Четырнадцатая международная мультиконференция. Тезисы докладов. Новосибирск, ИЦиГ СО РАН, 2024, 2372 с, ISBN 978-5-91291-067-8, с. 1277

Доклады: 

  1. Кожевникова ЕН. Роль метаболизма фосфолипидов в формировании поведенческих характеристик в норме и на модели хронического воспаления кишечника Muc2. II Российская конференция "Заболевания мозга – вызов XXI Века", 14-15 ноября 2024, Казань

  2. Кожевникова ЕН. Роль пропионат-продуцирующих бактерий в контексте теории "драйверов-пассажиров" на модели колоректального рака. VI международная научная конференция "Микробиота человека и животных", 14-16 октября 2024, Санкт-Петербург

  3. Kozhevnikova E. Ceramide affects intestinal epithelial barrier integrity via destabilization of actin cytoskeleton in chronic colitis. Международная Мультиконференция “Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология” BGRS/SB-2024, Симпозиум "Генетика/геномика, биоинформатика и системная биология животных", 5-10 августа 2024, Новосибирск

  4. Медведева СС. Роль церамидов в развитии синдрома повышенной проницаемости кишечника. 27-ая Пущинская школа-конференция “Биология - наука XXI века”, 22-25 апреля 2024, Московская обл., Пущино

  5. Сайдакова (Медведева) СС. In vitro и in vivo модели для изучения механизмов и подбора терапии при ВЗК. Вторая всероссийская школа-конференция "Биоресурсные коллекции биологических образцов пациентов с генетическими заболеваниями" в рамках II Научного Форума "Генетические ресурсы России". 26-28 июня 2023, Санкт-Петербург

  6. Болдырева ЛВ. Применение методов параллельного мультиплексного анализа (MPRA) для моделирования генетических заболеваний в культурах клеток. Вторая всероссийская школа-конференция "Биоресурсные коллекции биологических образцов пациентов с генетическими заболеваниями" в рамках II Научного Форума "Генетические ресурсы России". 26-28 июня 2023, Санкт-Петербург

  7. Болдырева ЛВ. Прижизненный имиджинг эксплантов эпителия как перспектива для персонализированной диагностики воспалительных заболеваний кишечника. Всероссийская  конференция "Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения" 21-24 июня 2022, Санкт-Петербург 

  8. Ачасова КМ. Органоиды в качестве in vitro модели для изучения механизмов нарушения проницаемости кишечника. Девятая конференция специалистов по лабораторным животным, 2-4 декабря 2021, Сколтех, Москва

  9. Кожевникова ЕН. Использование метода IGONAD для трансгенеза животных. Девятая конференция специалистов по лабораторным животным, 2-4 декабря 2021, Сколтех, Москва

  10. Морозова МВ. Влияние автоклавирования корма при барьерном содержании на репродуктивность мышей линии Muc2-/-, моделирующих колит, и их здоровых сиблингов Muc2+/-. Девятая конференция специалистов по лабораторным животным, 2-4 декабря 2021, Сколтех, Москва

Отдел регуляции генетических процессов

Служебные ссылки